首次外周T细胞淋巴瘤全基因组测序

文章来源:中华检验医学网 发布时间:2012-08-06
美国Mayo诊所的研究人员完成了世界上首个外周T细胞淋巴瘤的全基因组测序分析,外周T细胞淋巴瘤是一种高度侵袭性的免疫系统癌症,这项研究揭开了其背后鲜为人知的遗传学致病因素.

美国Mayo诊所的研究人员完成了世界上首个外周T细胞淋巴瘤的全基因组测序分析,外周T细胞淋巴瘤是一种高度侵袭性的免疫系统癌症,这项研究揭开了其背后鲜为人知的遗传学致病因素。

Mayo诊所病理学家Andrew Feldman博士在Illumina GAIIx, HiSeq测序平台上,对外周T细胞淋巴瘤进行了全基因组测序分析,在多发性外周T细胞淋巴瘤中发现了13个基因组异常。其中的5个与重要的p53蛋白的合成及其活性有关,由于p53蛋白在细胞周期中的核心作用及其抑癌能力,它常被称为“基因组的保卫者”。

该文章提前发表在8月1日Blood杂志的网络版上。

“每当我诊断出一例外周T细胞淋巴瘤,我都会想到有三分之二的患者会被这一疾病击败,”Feldman博士说。“这种感觉非常糟糕,而我希望这项研究能改变这一状况。”

外周T细胞淋巴瘤PTCL是成熟T淋巴细胞恶性肿瘤,约有12%的non-Hodgkin’s淋巴瘤是外周T细胞淋巴瘤,这种疾病的而死亡率非常高。在诊断出该疾病后,只有少于35%的患者能存活超过五年。由于人们缺少对外周T细胞淋巴瘤遗传学和分子发病机理的了解,使该疾病治疗缺少分子靶标,治疗效果也受到限制。

研究人员利用第二代测序技术和生物信息学工具,对16位外周T细胞淋巴瘤患者的组织样本以及6个外周T细胞淋巴瘤细胞系进行了全基因组测序分析。研究人员发现的关键性外周T细胞淋巴瘤基因组异常如下:

• 发现了13个反复发生的染色体重拍

• 发现了13个重排事件中有5个涉及具有重要的抑癌功能的p53基因,

• 发现了涉及TP53同源基因和TP63的新重排事件,新发现的TP63重排编码了一个融合蛋白,一个抑制p53通路的p63异构体。这些重排事件都与患者的存活期短有关

• 发现了4个染色体内的突变,包括已知的ALK和DUSP22-IRF4异位。

该研究为特定亚型的外周T细胞淋巴瘤提供了新的生物学诊断标记(机体系统中的化学或遗传学线索),并能帮助人们开发新的治疗手段。以前要取得这些进展并不容易,因为在显微镜下显得很相似的淋巴瘤可能实际上大为不同,使得人们难以预测其对治疗的反应。此外,科学家和医生们对于外周T细胞淋巴瘤发育和增殖机制的了解也相当有限。

“T细胞淋巴瘤最常见的类型被称作是‘无特殊说明’这基本就是个废纸篓似的诊断,这是因为我们对不同T细胞淋巴瘤亚型的特异性遗传学突变还了解的不够,而不同的亚型需要不同的治疗方式,”Dr. Feldman说。

Dr. Feldman的这项研究将有助于改善T细胞淋巴瘤的诊断,并帮助开发有针对性的治疗方法。

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